La Fondation des Marais de Damphreux (FMD), fondée en 1993, oeuvre pour la protection de marais et de zones humides en achetant des terrains dans la région de Damphreux et en faisant exploiter ceux-ci de manière extensive et durable.
A Damphreux, deux zones marécageuses (étangs des Coeudres et prairies humides de Pratchie) sont des bas-marais d’importance nationale. De plus, les étangs des Coeudres sont un site d’importance nationale pour la reproduction des Batraciens. Ils sont aussi le lieu d’escale des Limicoles le plus important du Canton du Jura et on peut y observer de nombreuses espèces d’oiseaux migrateurs